Antes llamado Hatogrande. Su nombre actual lo lleva en honor de Atanasio Girardot.
Aproximadamente en 1620 se fundó un hato de ganado llamado Hatogrande, en el sitio donde posteriormente se estableció Girardota, y luego se estableció un hato más en El Hatillo.
Hatogrande dependió de la Ciudad de Antioquia hasta 1675, cuando paso a la jurisdicción de la Villa de Medellín. En 1734 el doctor Sancho Londoño compró a Hatogrande y posteriormente estas tierras pasaron a manos del presbítero Manuel Londoño Molina, quien construyó una capilla dedicada a Nuestra Señora del Rosario y colocó en ella una imagen del Señor Caído que le había comprado a un comerciante quiteño.
El padre Londoño se considera como el fundador de la población. En 1757 se creó el partido de Hatogrande y en 1835 se creó la parroquia de Girardota. El municipio fue erigido en 1833.
Tiene un área total de 82 kilómetros cuadrados, de los cuales 1.5 kilómetros cuadrados pertenecen al casco urbano.
En la actualidad cuenta con una población de 38.655 habitantes aproximadamente, de donde el 48 % esta ubicado en la zona rural y el 52 % en la zona urbana.
La municipalidad de Girardota para honrar la memoria de prócer mas insigne de nuestra nación, el Coronel Atanasio Girardot, nacido en el municipio antioqueño de San Jerónimo, dispuso que así se llamara el pueblo como una manera de rendir testimonio o reconocimiento a tan valeroso militar