Se llamó San Juan de Andes: San Juan, por el río que lo cruza y Andes por la cordillera donde se asienta. En otra época se le conoció como la Cuidad Cóndor. En 1820 en Andes, el primer poblador fue el cacique Vicente Guaticamá, quien escapó de las autoridades de Chamí, Chocó, por haber asesinado a su esposa. En 1845 llegan colonos procedentes de Jericó, Concordia, Envigado, La Ceja, Pueblo Rico y El Retiro, al sitio conocido como Gólgota (hoy Andes). En junio de 1870 Andes, se eleva a la categoría de distrito municipal y parroquia.